Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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