Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms