Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrc1Q80VQ1 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms