Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.5 ms