Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Rph3alQ768S4 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Rph3alQ768S4 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Rph3alQ768S4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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