Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms