Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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