Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms