Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Usp49Q6P9L4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp49Q6P9L4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp49Q6P9L4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp49Q6P9L4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp49Q6P9L4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp49Q6P9L4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms