Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms