Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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