Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms