Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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