Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms