Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Trappc1Q5NCF2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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Trappc1Q5NCF2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Trappc1Q5NCF2 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Trappc1Q5NCF2 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Trappc1Q5NCF2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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