Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms