Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Trp53i11Q4QQM4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms