Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Trbv2-201ENSMUST00000103263 560 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms