Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms