Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms