Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms