Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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