Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms