Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms