Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms