Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms