Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm5742-201ENSMUST00000120764 505 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms