Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NfiaQ02780 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms