Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GscQ02591 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GscQ02591 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GscQ02591 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GscQ02591 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GscQ02591 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms