Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ascl1Q02067 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms