Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms