Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms