Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RptnP97347 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms