Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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