Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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