Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp25P57080 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp25P57080 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp25P57080 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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