Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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