Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PltpP55065 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PltpP55065 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PltpP55065 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PltpP55065 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PltpP55065 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PltpP55065 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PltpP55065 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms