Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ClgnP52194 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms