Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CntfP51642 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms