Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rfx1P48377 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rfx1P48377 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rfx1P48377 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rfx1P48377 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfx1P48377 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rfx1P48377 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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