Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms