Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms