Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pde6aP27664 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pde6aP27664 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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