Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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