Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eif3aP23116 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eif3aP23116 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms