Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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