Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms