Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PcnaP17918 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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