Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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